Hypnosis Mic: Alternative Rap Battle – 2nd Period

中央区で開催されたオルタナティブラップバトルから時が経ち、様々な事件が起きた東京にも平穏な日常が戻ってきていた。

そんな中、ネット上、特に若者の間で、ある噂が広がり始める。持つ者に「良いこと」をもたらすという謎の護符——「チャーム」。成績アップ、運命の人との出会い、莫大な富……幸せを求める人々が「チャーム」に殺到し、その行動はどんどん過激になっていく。

一方、オルタナティブラップバトル -リベンジ- の後、道檀辻路郎（DJ ROKURO）は忽然と姿を消していた。

噂の「チャーム」が、自分たちのDJメンター・路郎の失踪に関わっているかもしれないと知った主人公は、彼を探すため「チャーム」の真実を調査し始める。

池袋、横浜、渋谷、新宿、大阪、名古屋——
各部門に戻った18人のメンバーの協力を得て、主人公はメンターを探し続けるが、新たな脅威が迫り始めていた。